（一）网上办理：申请人通过“多证合一”方式提交申请，或登录“互联网+海关”一体化平台“企业管理和稽查”版块，或登录“中国国际贸易单一窗口”标准版“企业资质”子系统，向海关提出申请并上传加盖申请人印章的《报关单位备案信息表》。无需线下再递交材料。
窗口办理：向所在地海关提交加盖申请人印章的《报关单位备案信息表》原件。
（二）所在地海关对申请人提出的申请进行审核，备案材料齐全、符合进出口货物收发货人备案要求的，海关予以备案。备案信息通过“中国海关企业进出口信用信息公示平台”进行公布。
申请人要求提供纸质备案证明的，所在地海关提供《报关单位备案证明》（见附件1）。
海关备案登记流程如下：
1.注册为系统用户，为减少知识产权权利人申请时间和提高海关总署审核备案申请的效率，除特殊情况外，目前知识产权海关保护备案申请都应当通过“知识产权海关保护备案申请系统”提交。
2.录入备案申请数据，注册用户登录备案申请系统后，在申请新备案窗口内填写申请备案的知识产权和其他相关信息；
3.缴纳备案费，以银行转账或电汇方式将备案费（每项备案800元）汇入海关总署账户，汇款时必须在备注栏内注明权利授权号或备案申请编号；
4.提交纸面申请书，将已录入的备案申请数据打印成纸面申请书并加盖申请人或代理人印章，连同备案费缴款凭据复印件和其他相关材料邮递至海关总署。
5.补正申请，海关总署在收到申请人邮递的纸面申请后才开始进行审核。
6.收到核准或者驳回申请的通知，根据知识产权海关保护条例的规定，海关总署应当在自收到申请人提交的全部申请文件之日起30个工作日内将做出核准或者驳回申请的决定。