办理进出口许可证的流程主要包括以下几个步骤：

提出申请：申请人需要提交加盖公章的《中华人民共和国出口许可证申请表》原件以及有关出口货物配额或者其他有关批准文件。1

审核机关审核：审核人员对网上申请资料进行校核。

审批：资料填写正确、符合条件的当场给予核准通过。

办结：审批通过当场出具备案登记表。

送达：核准通过后,申请人前往政务服务中心或选择邮寄方式领取备案登记表。

需要注意的是，办理进出口许可证还需要到商务局办理备案登记手续，向海关办理登记手续，同时向公安局申请海关申报专用章，办理网络准入证和图书IC卡，办理注销备案手续，外汇账户开立申请和备案手续，办理出口退税登记。

此外，对于junpin出口许可证，应按规定向国家国防科技工业局申请审查批准，并获junpin出口许可证。