医疗器械经营许可证的办理地点是向所在地设区的市级食品药品监督管理部门提出申请。

如果企业注册在省级行政区域内，应当向所在地的省、自治区、直辖市食品药品监督管理部门申请办理医疗器械经营许可证。如果企业注册在直辖市行政区域内，应当向所在地的食品药品监督管理部门申请办理医疗器械经营许可证。

此外，部分地区可能需要在国家药品监督管理局或当地市场监管局进行办理。