第二类医疗器械经营备案凭证的有效期为五年。
    具体来说，根据《医疗器械生产监督管理办法》制定的规定，在《医疗器械生产许可证》中会载明有效期，该有效期为五年。这同样适用于第二类医疗器械经营备案凭证，其有效期也被设定为五年。在有效期内，持证人可以合法经营第二类医疗器械。然而，有效期届满后，如果需要继续经营，应当在有效期届满6个月前向原注册部门提出延续注册的申请。只有经过延续注册批准后，才能继续在市场上合法经营第二类医疗器械。