进出口公司在办理相关证件的过程中，通常需要遵循以下几个步骤：

营业执照：进出口公司必须拥有合法的营业执照，其营业范围应包括货物和技术的进出口业务。如果营业执照上的经营范围没有包含“货物进出口”或“技术进出口”业务，则需要对经营范围进行相应的变更登记。

对外贸易经营者备案登记：进出口公司需要在对外贸易主管部门办理对外贸易经营者备案登记，并获得对外贸易经营的资质。

海关登记：进出口公司需要到海关进行注册登记备案，并领取货物收发货人证书，以获取海关进出口代码。

出入境检疫检验备案：进出口公司需要到出入境检验检疫局备案，并取得检疫备案代码。

外汇管理备案：进出口公司需要到外汇管理局办理外汇收支的名录备案，并取得外汇账户的开户许可。

电子口岸开通：进出口公司需要到主管海关进行电子口岸的开通和备案，并领取读卡设备。

税务登记变更：进出口公司在办理以上各项手续的同时，还需到税务局办理税务登记变更，如出口退税登记手续。

此外，进出口公司还可能需要办理其他相关的证件和备案，具体包括但不限于商检证书、出口收汇核销备案登记核销卡等。