出口贸易需要在商务部门、海关以及外汇管理部门进行备案。

商务部门备案：根据《中华人民共和国对外贸易法》的相关规定，从事对外贸易的经营者需要办理备案登记。因此，出口贸易企业需要在当地的商务部门进行对外贸易经营者备案登记，这是开展出口贸易的首要步骤。

海关备案：根据《中华人民共和国海关法》的规定，进出口货物收发货人需要向海关备案。出口贸易企业需要在海关进行备案，以便海关对进出口货物进行监管，并保护相关知识产权。备案时，企业需要提供相关的基本证件、申报人员身份证明、进出口货物资料等。

外汇管理部门备案：出口贸易涉及外汇收支，因此还需要在外汇管理部门进行备案。企业需要向外汇管理部门申请出口核销备案，以便按照国家外汇管理规定进行外汇收支和核销。

出口贸易需要在商务部门、海关以及外汇管理部门进行备案，以确保企业合法开展出口贸易，并遵守国家相关法律法规的规定。