申请人通过互联网+海关或者单一窗口的子系统，“中国出口食品生产企业备案管理系统”，向企业所在地海关申请备案，填写企业基本信息、企业获证情况以及企业承诺书。

在网上申请后，还应该向海关提交如下材料：

1. 出口食品生产企业备案申请表

2. 配料成分

3. 合格的供应商名录

4. 工艺流程图

5. 质量控制流程管理文件

6. 产品正标背标图片

7. 国外客户所在国家的食品市场准入要求

8. 海关要求的其它材料临时补充

主管海关对申请人提交的备案材料进行审核，如果需要下场核验，要求技术人员陪同，对材料齐全并符合法定条件的，予以备案，备案成功后系统将生成电子版《出口食品生产企业备案证明》。