西安公司想要注销医疗器械二类备案，可以按照以下步骤进行操作

1. 首先，西安公司需要向当地监管部门提交注销申请。可以联系当地卫生部门或食品药品监督管理局，了解如何提交申请并提供相关信息。

2. 监管部门将审核申请，如果申请被批准，公司将收到注销证明文件，并按照证明上的要求行事。如果申请被拒绝，公司可能需要重新提交申请并回答有关疑问。

3. 接下来，西安公司将需要准备好注销备案所需的所有文件和资料。这些文件包括但不限于公司营业执照、组织机构代码证、税务登记证、第二类医疗器械备案申请表、产品说明书、销售发票、产品质量证明等。

4. Zui后，西安公司需要到监管部门进行注销备案的现场审核。审核过程中，公司需要提供所有文件和资料，并回答监管部门的问题。现场审核通常需要进行一段时间，具体时间由监管部门决定。

注销医疗器械第二类备案需要准备充分完备的文件和资料，并按照监管部门的要求进行审核和现场审核。如果北京公司需要进行多次审核，需要提前通知监管部门并按照要求安排审核时间。

一、准备注销资料

准备“第二类医疗器械注销申请表”，该表格可从国家药品监督管理局网站下载或向当地药品监督管理部门索取。

提供与注销产品相关的全部医疗器械产品注册证，注册证明文件必须真实有效，如有缺失或过期等情况，需进行说明并提交相关证明文件。

提交与注销产品相关的所有销售记录和库存情况，包括销售合同、发票、库存清单等，以确保所有已售出和库存的产品均已全部注销。

二、网上提交注销申请

登录国家药品监督管理局医疗器械注册管理系统或“中国食品药品检定研究院”网站，选择“第二类医疗器械注销申请”。

点击“在线办理”，进入系统登录界面。

填写注销申请表中的企业信息和产品基本信息，包括企业名称、统一社会信用代码、产品名称、注册证号等信息。

上传产品注册证、销售记录和库存情况等相关文件，并提交申请表和相关文件，完成注销申请流程。

三、等待审核结果

提交注销申请后，需等待国家药品监督管理局审核注销申请资料。

审核通过后，打印出“第二类医疗器械注销申请受理通知书”，并将该通知书与相关证明文件一并提交给当地药品监督管理部门。

如审核未通过，需根据审核意见重新填写申请表和相关文件，再次提交申请。

四、现场核查及决定

当地药品监督管理部门将对注销申请进行现场核查，确保企业已全部销毁注销产品的库存，并回收所有相关文件资料。

核查通过后，当地药品监督管理部门将颁发“第二类医疗器械注销证明”，并将相关决定及时通知申请人。

如核查未通过，需根据当地药品监督管理部门的要求进行整改并重新提交申请。